משרד החקלאות ופיתוח הכפר פרסם את תוצאות סקר שאריות חומרי הדברה במוצרי מזון אורגניים בשנת 2010, בהן יש ירידה משמעותית באחוז החריגה ועלייה בסימון הנכון של המוצרים האורגניים בסמלים הנדרשים.   בשנה שחלפה נמצאו 8.6% מהמוצרים עם חריגה בשאריות חומרי הדברה, לעומת 24% חריגה בשנת 2009.

בין המוצרים שנבדקו במסגרת סקר 2010 נכללו תוצרת טרייה ומעובדת, ביניהם: עגבניות, תבליני עלים, פלפלים, חסה, לחמים, פסטות, קטניות, ריבות, דברי מאפה, פירות יבשים.

התוצרת החקלאית האורגנית הטרייה והמעובדת מן הצומח מפוקחת על פי חוק משנת 2008, עת נכנסו התקנות להסדרת הייצור והמכירה של תוצרת אורגנית מן הצומח לתוקף. צרכן המעוניין לצרוך תוצרת אורגנית צריך לחפש את הסמל האורגני האחיד על המוצרים האורגניים של משרד החקלאות ופיתוח הכפר, על מנת לדעת בביטחון כי המוצר שהוא רוכש אכן גודל ויוצר על פי הסטנדרט האורגני והוא מפוקח על ידי אחד מגופי האישור והבקרה שהסמיך משרד החקלאות.
בשנת 2010 הסמיכה מנהלת השירותים להגנת הצומח ולביקורת במשרד החקלאות, גוף אישור ובקרה נוסף, "דרך המעבדה", שמצטרף לשלושת גופי הבקרה הקיימים, "סקאל ישראל", "אגריאור" ו"המכון לבקרה ואיכות", המוסמכים לתת למגדל וליצרן האורגני את ההיתר לסמן בסמל האורגני.

מאז כניסת החוק לתוקף, מבצע המשרד "פיקוח על" מעבר לביקורת השוטפת שמבצעים גופי הפיקוח על התוצרת האורגנית בישראל הן ברמת שאריות חומרי הדברה והן ברמת עקיבות וסימון המוצרים לצרכן. במסגרת הסקר בודקים מפקחי השירותים להגנת הצומח ולביקורת שלושה פרמטרים: 
בדיקת עקיבות – האם היצרן או המגדל מפוקח על ידי אחד מגופי האישור והבקרה המוסמכים.
בדיקת סימון – בדיקה האם תווית המוצר נושאת את הסמל האורגני וסמל גוף הפיקוח כפי שדורש החוק, אשר מאפשר לצרכן לזהות כי מדובר במוצר אורגני מפוקח, וכן האם מופיע שם היצרן של המוצר, כנדרש. 
בדיקות מעבדה לשאריות חומרי הדברה – בדיקה האם במוצרים יש שאריות חומרי הדברה האסורים לשימוש בחקלאות האורגנית.

מתוצאות הסקר של שנת 2010 עולה כי מרבית החריגות נמצאו בלחמים, בשל הקושי להשיג גלוטן נקי משאריות חומרי הדברה. שאר החריגות היו בפירות מיובשים שמקורם בייבוא. לאור תוצאות הסקר, הנחה משרד החקלאות ופיתוח הכפר את יצרני הלחמים האורגניים לבצע בדיקות מעבדה מקדימות לגלוטן טרם השימוש בו לייצור לחם אורגני. ואכן בדיקות שערך משרד החקלאות בסוף שנת 2010 מראים באופן ברור על ירידה משמעותית באחוז החריגות בלחמים אורגנים. עוד נמצא בסקר שכלל הפירות והירקות שנבדקו נמצאו נקיים משאריות חומרי הדברה.

עוד נמצא בסקר כי עיקר החריגות בשימוש בסמלי החוק הינו במוצרים מעובדים. בשנת 2010 מחצית מהמוצרים בשוק (48%) מסומנים כנדרש בסמלי החוק, כך שבתווית המוצר מופיעים הסמל האורגני וסמל הפיקוח, אשר מאפשרים לצרכן לזהות כי מדובר במוצר אורגני מפוקח. בסקר הקודם בשנה שעברה (שנת 2009) 9% בלבד מהמוצרים סומנו כנדרש. השירותים להגנת הצומח ולביקורת במשרד החקלאות דרשו מגופי הפיקוח לאשר תוויות חדשות, שיסומנו בהתאם לחוק כנדרש.

רוב מכריע של היצרנים והמגדלים המסמנים את תוצרתם בסמל האורגני של מדינת ישראל מפוקחים על ידי אחד מגופי האישור והבקרה המוסמכים כחוק, אך עדיין ישנם יצרנים המשתמשים בסמל בניגוד לתנאי החוק (97% לעומת 91% בשנה שעברה). 

החקלאות האורגנית בישראל מהווה כ- 1.5% מכלל התוצרת החקלאית המיוצרת בישראל וכ- 13% מכלל הייצוא החקלאי. בענף עוסקים כ- 760 אנשים, מתוכם כ- 500 חקלאים. כ- 70,000 דונם מגודלים כאורגני לפי הפילוח: גידול בשטח פתוח – 65%, פירות – 18%, הדרים – 7%, ירקות (בבתי גידול) – 6%, תבלינים – 4%.